La Red Brasil de Tecnología se maneja a través de dos cuerpos: Comité Directivo de la Articulación Institucional y la Secretaría Ejecutiva.

El Comité Directivo debe aprobar los proyectos y las acciones estratégicas de la red. Es presidido por el Ministerio de la Ciencia y Tecnología y formado por los representantes de las siguientes instituciones:

· Ministerio de la Ciencia y Tecnología (MCT);
· Ministerio del Desarrollo, de la Industria y del Comercio Exterior (MDIC);
· Confederación Nacional de la Industria (CNI);
· Instituto de Investigación para el Desarrollo Industrial (IEDI);
· Servicio Brasileño de Apoyo a la Pequeña y Micro Empresa (SEBRAE).

Las atribuciones principales de la Secretaria Ejecutiva son estructurar un conjunto de redes provinciales; gerenciar la Red Brasil de Tecnología; y informar al Comité Directivo sobre las acciones y las demandas estratégicas de cada red provincial. La Secretaría Ejecutiva es presidida por un representante del Ministerio de la Ciencia y Tecnología y apoyada por un Consejo Consultivo multi-institucional cuya misión es ayudar en la ejecición de las acciones estratégicas de la Red.